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今日更新質粒圖譜(一分鐘教你讀懂質粒圖譜)

2022-04-29 08:00:37 行業(yè)快訊 來源:
導讀 目前大家應該是對質粒圖譜(一分鐘教你讀懂質粒圖譜?。┍容^感興趣的,所以今天好房網小編CC就來為大家整理了一些關于質粒圖譜(一分鐘教你
目前大家應該是對質粒圖譜(一分鐘教你讀懂質粒圖譜!)比較感興趣的,所以今天好房網小編CC就來為大家整理了一些關于質粒圖譜(一分鐘教你讀懂質粒圖譜!)方面的相關知識來分享給大家,希望大家會喜歡哦。

質粒圖譜(一分鐘教你讀懂質粒圖譜?。?/p>

質粒圖譜為質粒DNA序列的物理圖譜,提供了包括質粒的大小、篩選標記、克隆位點、轉錄及翻譯元件等信息,為我們選擇質粒、了解質粒特點及應用提供了重要依據。對于初學者來說改如何去閱讀質粒圖譜呢?今天來給大家講解一下如何閱讀質粒圖譜,底部還有質粒、酶切切點選擇的相關教學視頻。

質粒的組成要素有哪些

復制起始位點:Ori 即控制復制起始的位點。原核生物 DNA 分子中只有一個復制起始點。而真核生物 DNA 分子有多個復制起始位點。

抗生素抗性基因:可以便于加以檢測,如 Amp+ ,Kan+。

多克隆位點MCS:克隆攜帶外源基因片段。

P/E 啟動子/增強子

Terms 終止信號

加poly(A)信號:可以起到穩(wěn)定 mRNA 作用

一分鐘教你讀懂質粒圖譜!

如何閱讀質粒圖譜

第一步:首先看 Ori 的位置,了解質粒的類型(原核/真核/穿梭質粒)。

第二步:再看篩選標記,如抗性,決定使用什么篩選標記。

Ampr 水解 β-內酰胺環(huán),解除氨芐的毒性。

tetr 可以阻止四環(huán)素進入細胞。

camr 生成氯霉素羥乙?;苌?,使之失去毒性。

neor(kanr) 氨基糖苷磷酸轉移酶 使 G418(長那霉素衍生物)失活。

hygr 使潮霉素 β 失活。

第三步:看多克隆位點(MCS)。

它具有多個限制酶的單一切點。便于外源基因的插入。如果在這些位點外有外源基因的插入,會導致某種標志基因的失活,而便于篩選。決定能不能放目的基因以及如何放置目的基因。

第四步:再看外源 DNA 插入片段大小。

質粒一般只能容納小于 10 Kb 的外源 DNA 片段。一般來說,外源 DNA 片段越長,越難插入,越不穩(wěn)定,轉化效率越低。

第五步:是否含有表達系統(tǒng)元件,即啟動子-核糖體結合位點-克隆位點-轉錄終止信號。

這是用來區(qū)別克隆載體與表達載體??寺≥d體中加入一些與表達調控有關的元件即成為表達載體。選用那種載體,還是要以實驗目的為準繩。

啟動子-核糖體結合位點-克隆位點-轉錄終止信號

啟動子-促進 DNA 轉錄的 DNA 順序,這個 DNA 區(qū)域常在基因或操縱子編碼順序的上游,是 DNA 分子上可以與 RNApol 特異性結合并使之開始轉錄的部位,但啟動子本身不被轉錄。

增強子/沉默子-為真核基因組(包括真核病毒基因組)中的一種具有增強鄰近基因轉錄過程的調控順序。其作用與增強子所在的位置或方向無關。即在所調控基因上游或下游均可發(fā)揮作用。/沉默子-負增強子,負調控序列。

核糖體結合位點/起始密碼/ SD 序列(Rbs/AGU/SDs):mRNA 有核糖體的兩個結合位點,對于原核而言是 AUG(起始密碼)和 SD 序列。

轉錄終止順序(終止子)/翻譯終止密碼子:結構基因的最后一個外顯子中有一個 AATAAA 的保守序列,此位點 down-stream 有一段 GT 或 T 富豐區(qū),這 2 部分共同構成 poly(A)加尾信號。結構基因的最后一個外顯子中有一個 AATAAA 的保守序列,此位點 down-stream 有一段 GT 或 T 富豐區(qū),這 2 部分共同構成 poly(A)加尾信號。

第六步:質粒圖譜上的箭頭。

有的箭頭順時針有的箭頭逆時針,那其實是代表兩條 DNA 鏈,即質粒是環(huán)狀雙鏈 DNA,它的啟動子等在其中一條鏈上,而它的抗性基因在另一條鏈上。


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